تسعى الامانة العامة للمكتبة المركزية ومن خلال التنسيق مع الجهات ذات العلاقة الى تحقيق الاهداف التالية:-
1- إدارة المخاطبات الرسمية فيما يخص بريد المكتبة وشعبها ووحداتها العاملة اتجاه الجامعة والكليات.
2- تنظيم هوية المكتبة المركزية للسادة التدريسيين وطلبة الدراسات الاولية والعاملين من موظفي الجامعة.
3- توفير مصادر المعلومات بمختلف أنواعها.
4- تنظيم مصادر المعرفة تنظيما فنيا يساعد المستفيدين من الباحثين والطلبة في الوصول اليها بسهولة ويسر.
5- ادخال وتصنيف وفهرسة مصادر المعرفة وفق نظام المكتبة الطبية الامريكية National Library of Medicine .
6- ضبط جودة الخدمات المقدمة في المكتبة وفقا لأحدث المعايير العالمية، من اجل دعم اعضاء الهيئة التدريسية والطلبة فضلا عن متطلبات البحث العلمي.
7- الأشراف الفني على مكتبات الكليات المرتبطة بالجامعة بما يؤمن مركزية الإجراءات الفنية.
8- رفع مستوى كفاءة العاملين من خلال التدريب المستمر وتأهيلهم ليكونوا اخصائي معلومات.
9- اقامة وحضور معارض الكتب التي تقيمها جهات أخرى سواء على الصعيد المحلي او الدولي.
10- تنظيم الندوات والمؤتمرات والحلقات الدراسية والمشاركة في مثل هذه النشاطات التي تنظمها جهات اخرى.