تسعى الامانة العامة للمكتبة المركزية ومن خلال التنسيق مع الجهات ذات العلاقة الى تحقيق الاهداف التالية:-

1- اعداد اللوائح والسياسات التي تنظم سير العمل بمكتبة جامعة ابن سينا للعلوم الطبية والصيدلانية، والخاصة بعمليات التزويد والاعارة والجرد والاستبعاد وغيرها من الاجراءات.
2- اقتناء واتاحة كافة أنواع وأشكال اوعية المعلومات المرتبطة بالبرامج التعليمية والبحثية للجامعة سواء بالشراء أو التبادل أو الاهداء لخدمة العملية التعليمية والبحثية بجامعة ابن سينا للعلوم الطبية والصيدلانية.
3- تنظيم وفهرسة وتصنيف كافة أوعية المعلومات المتاحة بمكتبة جامعة ابن سينا للعلوم الطبية والصيدلانية وفقا للمعايير والقواعد العالمية المتبعة، واعداد ادوات البحث المختلفة.
4- توفير وسائل وسبل تنمية مهارات الوصول للمعلومات لدى المستفيدين.
5- تطبيق معايير الجودة العالمية للمكتبات لتطوير مكتبة الجامعة ومصادر المعلومات.
6- التطوير المستمر لموظفي الامانة العامة للمكتبة المركزية في مجال المكتبات والمعلومات.
7- ارساء وتطوير علاقات التواصل والتعاون مع المؤسسات الاخرى على المستوى المحلي والإقليمي والدولي.